Test NIRVANA szybko identyfikuje i sekwencjonuje warianty wirusa COVID-19

Naukowcy z Salk Institute w Kalifornii, współpracując z zewnętrznymi współpracownikami, opracowali test COVID-19, który może szybko zidentyfikować i sekwencjonować wirusa sprawczego, pomagając w śledzeniu nowych wariantów. Test, zwany „sekwencjonowaniem nanoporów izotermicznej szybkiej amplifikacji wirusa do analizy w czasie zbliżonym do rzeczywistego” (NIRVANA), może jednocześnie wykrywać inne wirusy, takie jak grypa, które mogą powodować podobne objawy.

Ponieważ SARS-CoV-2 nadal mutuje, władze ds. Zdrowia są coraz bardziej zaniepokojone tym, że nowe warianty są bardziej niebezpieczne, bardziej przenośne i trudniejsze do leczenia lub szczepienia. Obecnie wymagany jest test PCR, aby wykryć SARS-CoV-2, a następnie potrzebne jest dodatkowe sekwencjonowanie genetyczne w celu zidentyfikowania wariantu wirusa, co wymaga nieporęcznego i kosztownego sprzętu laboratoryjnego. Ta nowa technologia ma na celu połączenie tych wyników w jednym teście, który jest mały i przenośny.

„Jest to metoda wykrywania i nadzoru wirusów, która nie wymaga kosztownej infrastruktury, jak inne podejścia” – powiedział w komunikacie prasowym firmy Salk Juan Carlos Izpisua Belmonte, badacz zaangażowany w badanie. „Za pomocą jednego przenośnego testu możemy osiągnąć to samo, co inni używają do wykonania dwóch lub trzech różnych testów na różnych maszynach”.

Podejście to nosi nazwę izotermicznej amplifikacji polimerazy rekombinazy (RPA). Wykorzystuje białka do oddzielania i kopiowania nici DNA w zaledwie 20 minut, co różni się od PCR, który wymaga cykli temperaturowych, aby osiągnąć to samo. Technologia obejmuje również technikę zwaną sekwencjonowaniem nanoporów w czasie rzeczywistym i umożliwia naukowcom sekwencjonowanie regionów wirusa, które są podatne na mutacje, pomagając im śledzić warianty. Ponadto test może oceniać próbki pod kątem innych wirusów, takich jak grypa.

„Szybko zdaliśmy sobie sprawę, że możemy wykorzystać tę technikę nie tylko do wykrywania SARS-CoV-2, ale także innych wirusów w tym samym czasie” – powiedział Mo Li, inny badacz zaangażowany w badanie. „Możemy łatwo dostosować go do zwalczania innego patogenu, nawet czegoś nowego i wyłaniającego się”.

Mały, przenośny test terenowy wykorzystuje tę technologię i może analizować 96 próbek jednocześnie. Może to być przydatne do szybkiej kontroli na lotniskach lub w szkołach. „Pandemia dostarczyła dwóch ważnych lekcji: po pierwsze, przetestuj szeroko i szybko, a po drugie poznaj swoje warianty. Nasza metoda NIRVANA stanowi obiecujące rozwiązanie tych dwóch wyzwań nie tylko związanych z obecną pandemią, ale także dla potencjalnych przyszłych ”- dodał Izpisua Belmonte.

Studiuj w dzienniku Med: Jednoczesne wykrywanie i nadzór nad mutacjami SARS-CoV-2 i koinfekcji wielu wirusów układu oddechowego za pomocą szybkiego sekwencjonowania w terenie

Przez: Salk Institute

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *